La gouvernance du CTC fonctionne grâce à trois espaces principaux :

• Chaque trimestre, les organisations membres se retrouvent en comité de pilotage pour définir les grandes orientations du collectif.
• À partir de ces grandes orientations, la coordination composée de 5 à 8 représentant·es des organisations membres élus par le comité de pilotage élabore la stratégie opérationnelle du collectif.
• Cette stratégie est ensuite mise en œuvre par des groupes projet auxquels participent les organisations membres volontaires.

Le CTC compte une équipe de 6 personnes salariées qui assurent la mise en œuvre opérationnelle de sa stratégie.

Toutes travaillent à temps partiel, entre 2,5 et 4 jours par semaine selon les choix de chacun·e.